jak zachować notatnik laboratoryjny

gdzie włożyłem ten kawałek papieru? Kiedy przeprowadziłem ten eksperyment? Gdzie zapisałem ten plik? Jeśli często szukasz krytycznej informacji, którą zapisałeś podczas przeprowadzania eksperymentu, próbując zapamiętać, kiedy co zrobiłeś, lub przeszukując dysk twardy, aby znaleźć odpowiedni plik, może nadszedł czas, aby ponownie zastanowić się, jak zachować notatki z badań. Niezależnie od tego, czy pracujesz na ławce, w terenie, czy w teorii, musisz śledzić to, co robisz, aby Ty—i inni—mogli się do tego odnieść w razie potrzeby.

poza tradycyjnym papierowym notatnikiem dostępnych jest wiele narzędzi, które pomagają naukowcom dokumentować ich pracę i postępy, ale rzadko uczy się, jak zachować dobry notatnik. Wiele instytucji badawczych, instytucji finansujących i stowarzyszeń zawodowych ma wymagania lub oferuje wytyczne. Ale oprócz upewnienia się, że nie łamiesz żadnych zasad, często jest miejsce na kreatywność i osobiste preferencje—pod warunkiem, że notetaking jest skuteczny. Kariera naukowa poprosiła naukowców z różnych dyscyplin i etapów kariery o podzielenie się wskazówkami i strategiami, które dla nich działają. Ich odpowiedzi zostały edytowane dla jasności i zwięzłości.

prowadzenie zeszytu badawczego jest często postrzegane jako obowiązek. Dlaczego tak ważne jest, aby poświęcić temu wystarczająco dużo czasu i wysiłku?

Zeszyty laboratoryjne są jak chodzenie do dentysty—nikomu się to nie podoba, ale jeśli tego nie zrobisz, wszystkie zęby Ci wypadną. Zeszyty laboratoryjne są najbardziej użytecznym zasobem, który możesz stworzyć dla siebie w laboratorium, a tworzenie dobrego wymaga odrobiny wysiłku każdego dnia. Kiedy wchodzisz w nawyk i masz system, który Ci się podoba, staje się mniej uciążliwy.
– Caroline Bartman, Postdoctoral fellow in quantitative metabolomics at Princeton University

mój notatnik laboratoryjny śledzi wszystkie moje eksperymenty badawcze, wszystkie moje niepowodzenia i optymalizacje. To świetne narzędzie do utrzymania rygoru i powtarzalności—jeśli nie pamiętam, jak przeprowadziłem eksperyment lub jak analizowałem dane, Wszystkie te informacje są w moim notatniku. Znacznie ułatwia to również przyszłym kolegom z laboratorium, którzy mogą potrzebować wykonać podobny eksperyment i chcą zobaczyć, czego już próbowałeś.
– Maiko Kitaoka, doktorantka w dziedzinie biologii molekularnej i komórkowej na Uniwersytecie Kalifornijskim w Berkeley

staranna dokumentacja moich eksperymentów pomogła mi zrozumieć pewne wyniki. Odnotowanie tego, co wydarzyło się w danym dniu, może dać wskazówki, Czy niektóre dane są odstające z powodu czynników środowiskowych, takich jak zmiana temperatury. Z czasem mój notatnik laboratoryjny przekształcił się w narzędzie do śledzenia moich pomysłów. Możesz nie chcieć zmieniać swojego projektu lub metody w samym środku eksperymentu, ale twój notatnik jest idealnym miejscem, aby zanotować, co chcesz wypróbować dalej.
– Valentina Ferro, Ph. D.- posiadacz fizyki eksperymentalnej i niezależny ilustrator naukowy w Seattle, Waszyngton

w dziedzinie teoretycznej, takiej jak moja, notatnik jest niezbędny do śledzenia moich prób rozwiązania problemu. Bez dobrze napisanych notatek prawdopodobnie wykonałbym te same obliczenia wiele razy. Notatnik jest również przydatny do dzielenia się moimi podejściami i wynikami ze współpracownikami.
– Matteo Falessi, doktor habilitowany fizyki plazmy w Centrum Badawczym ENEA Frascati we Włoszech

powrót do starych danych bez silnej dokumentacji może być trochę jak ekspedycja archeologiczna. Dobry notatnik pozwala szybko zobaczyć, jakie eksperymenty zostały wykonane i z jakimi celami, ponownie ocenić stare dane w świetle nowych ustaleń i odebrać pracę tam, gdzie ją zostawiłeś. Szerzej, dobre notatki umożliwiają powtarzalność badań; dostarczyć pisemnych dowodów, że wszystko zostało zrobione w sposób jasny, przejrzysty i etyczny; i oferują uzasadnienie dla tego, dlaczego dokonano pewnych wyborów badawczych.
– Caroline Lynn Kamerlin, profesor biologii strukturalnej na Uniwersytecie w Uppsali w Szwecji

jeśli piszesz artykuł miesiące, a nawet lata po zakończeniu eksperymentów, twój notatnik laboratoryjny będzie zawierał wszystkie szczegóły potrzebne do dokładnego opisu metod i wyników. W pewnym momencie swojej kariery zawodowej, być może będziesz musiał użyć go do udowodnienia, że pomysł naprawdę był „twój” lub do roszczenia do twojej własności intelektualnej. Dodatkowo, w przypadku oskarżeń o nierzetelność naukową, twój notatnik laboratoryjny będzie nieodzownym elementem w śledztwie. Ostatecznie notatnik laboratoryjny będzie działał jako rejestr Twojej kariery i stanie się częścią twojego dziedzictwa jako naukowca. Nie zaniedbuj tego!
– Jeremy C. Borniger, postdoctoral fellow in neuroscience na Uniwersytecie Stanforda w Palo Alto w Kalifornii

czy używasz tradycyjnego notatnika papierowego, narzędzi cyfrowych lub kombinacji?

lubię używać odręcznego notatnika, mimo że większość danych, które tworzę, jest cyfrowa. Czasami zapisuję również szczegóły techniczne—takie jak określone ustawienia akwizycji na mikroskopach lub eksperymenty, które połączyłem, aby stworzyć figurę-w plikach tekstowych, w których najłatwiej je znaleźć. Jednym z wyzwań w przypadku tradycyjnego papierowego notatnika jest jednak to, że nie zawsze jest on łatwy do przeszukiwania, więc korzystam z pierwszych kilku stron, aby zachować spis treści i tak często, jak to możliwe, porównuję moje cyfrowe pliki danych.
– Kitaoka

uważam, że elektroniczny notatnik laboratoryjny jest o wiele lepszy niż papierowy. Można go przeszukiwać, więc mogę łatwo pobrać zapisy eksperymentów, które zrobiłem lata temu lub przeczesać go, aby znaleźć kluczowe szczegóły. Nigdy go nie zniszczę przez przypadkowe dodanie zlewki etanolu. I tak długo, jak będziesz to popierał, nie da się przegrać. Dodatkowo, muszę wypełnić go przy biurku bez rękawiczek, co zmusza mnie do poświęcenia na to czasu.
– Bartman

używałem papierowego notatnika od samego początku mojej kariery naukowej, ale z czasem musiałem dostosować swoją strategię, ponieważ zgubiłem się na tych wszystkich stronach. Dziś używam mojego notatnika laboratoryjnego tylko do zapisywania szybkich notatek. Wszystkie moje zoptymalizowane protokoły, surowe dane i analizy są przechowywane na komputerze. Porównuję wpisy z mojego notatnika i pliki komputerowe, używając daty i krótkiego opisu każdego eksperymentu. Dodatkowo uważam, że warto zachować oddzielny notatnik badawczy dla szerszych zagadnień, takich jak konceptualizacja eksperymentu, sporządzanie rękopisu, organizowanie spotkania lub robienie notatek na konferencji.
– Karine Salin, stały pracownik naukowy w dziedzinie fizjologii środowiska W IFREMER w Plouzané we Francji

więcej pomysłów mam na papierze, więc początkowo chciałem mieć tradycyjny notatnik za wszelką cenę. Ale pracowałem nad kilkoma projektami i potrzebowałem, aby mój notatnik był przeszukiwalny i tagowany, aby łatwiej śledzić. Najlepszym miejscem dla mnie było użycie cyfrowego notatnika, takiego jak Evernote, z możliwością dołączania migawek tradycyjnych notatek długopisowych i papierowych, a także skryptów kodujących i innych plików cyfrowych i obrazów, które wygenerowałem. Dodatkowo, posiadanie aplikacji w telefonie oznaczało, że mogłem nagrywać notatki głosowe podczas chodzenia, jeśli mam pomysł, który chciałem wypróbować później. Jednak w przypadku cyfrowego notebooka prawie niemożliwe jest znalezienie rzeczy, o których zapomniałeś, tak jak po prostu przeglądasz strony swojego papierowego notatnika. Pokonałem problem, oznaczając to, co było nieco mniej istotne dla eksperymentów—na przykład niepowiązane pomysły i dalsze pytania do kontynuowania-tagiem „random”, aby co jakiś czas móc je przeglądać w poszukiwaniu inspiracji.
– Ferro

do większości moich prac wystarczy papierowy notes. Jednak upewniam się, aby utworzyć cyfrową kopię zapasową wszelkich notatek, robiąc zdjęcie za pomocą aplikacji Genius Scan lub zapisując je w programie Microsoft Word. Mam również folder komputerowy, w którym przechowuję wszystkie moje standardowe protokoły, dzięki czemu mogę po prostu odwoływać się do nich, zamiast pisać całą rzecz w moim notebooku za każdym razem, gdy robię eksperyment. Dodatkowo dla każdej linii pracy mam osobne, oznakowane segregatory, w których umieszczam notatki i dane, które nie mieszczą się łatwo w notatniku, takie jak wydruki Microsoft Excel, dane graficzne, umowy i umowy o przesyłaniu materiałów.
-Borniger

piszę swój cyfrowy notatnik w trybie Org-mode, języku znaczników zaprojektowanym specjalnie do łatwego wstawiania odręcznych obrazów, takich jak wyniki, obliczenia, równania, tabele, bibliografie, a nawet fragmenty kodu. Sam notatnik składa się z kilku połączonych plików tekstowych, więc kiedy mam papier do napisania, mogę łatwo użyć plików tekstowych jako szkiców, eksportując je do pliku LaTeX.
– Falessi

używam głównie notatnika elektronicznego, ale często w laboratorium najpierw zapisuję swoje notatki w papierowym notatniku-nigdy kawałku papieru—a następnie skanuję swój papierowy notatnik, aby w każdej chwili mieć dostęp do jego zawartości. Używam Confluence do zapisu elektronicznego, ale Microsoft OneNote to kolejna dobra opcja, ponieważ można go używać offline i online i jest bezpłatny. Odsyłam za pomocą numerów stron z mojego papierowego notatnika oraz dat i nazw eksperymentów w moich nazwach plików. Wszystkie moje protokoły są w moim cyfrowym notebooku-często ze zdjęciami moich eksperymentalnych ustawień, materiałów, sprzętu, a czasami zapisem wideo, na którym rozmawiam przez każdy krok protokołu. Przechowuję moje surowe dane na serwerze mojego laboratorium i wykonuję ich kopię zapasową w chmurze i na dysku twardym. Mój kod do przetwarzania i analizy danych znajduje się na Github, popularnym systemie wersjonowania oprogramowania. Na koniec prowadzę listę rzeczy do zrobienia w moim elektronicznym notatniku, który służy również jako zapis tego, co osiągnąłem każdego tygodnia.
– Lina Colucci, research affiliate in health sciences and technology w Massachusetts Institute of Technology w Cambridge i data science consulting entrepreneur w San Francisco Bay Area

jakie strategie stosujesz, aby utrzymać porządek, kompletność i zgodność z najlepszymi praktykami?

dla mnie to, co działa, to traktować notetaking jako ważny eksperymentalny krok. Zwykle zapisuję rzeczy w miarę upływu czasu, od czasu do czasu zapisuję protokół lub to, co zamierzam zrobić przed rozpoczęciem eksperymentu, a następnie edytuję wszystko, co zrobiłem inaczej niż planowałem. W ten sposób prowadzenie notatnika laboratoryjnego jest podobne do gotowania, gdzie czyszczenie przez cały proces sprawia, że jest to o wiele łatwiejsze niż czekanie do końca, gdy naczynia są ułożone na suficie. Jak najszybsze wypełnienie zeszytu laboratoryjnego zmniejsza również szanse na zapomnienie istotnej informacji lub wprowadzenie błędu.

jeśli chodzi o sposób, w jaki mój papierowy notatnik jest zorganizowany, po prostu postępuję zgodnie z kolejnością chronologiczną, więc każda strona jest nowym dniem (chyba że używam wielu stron w ciągu dnia). Upewniam się, że dołączam szczegółowy opis tego, co zrobiłem, dlaczego i jak w czasie teraźniejszym; datę, godzinę i miejsce wykonania pracy; nazwiska wszystkich innych, z którymi wykonałem pracę; szczególne okoliczności, które miały miejsce podczas pracy (na przykład, czy był alarm przeciwpożarowy, który mógł mieć wpływ na wyniki?); oraz mój podpis i, jeśli to możliwe, znak świadka (Zwykle mój główny badacz lub kolega laboratoryjny). Wszystko to powinno być napisane długopisem, a jeśli coś było błędem, nie wykreślaj tego całkowicie; wystarczy przełożyć jedną linię, aby nadal można było ją odczytać. Zapisywanie pomysłów (a nie metodologii) jest również dopuszczalne i zachęcane.
– Borniger

w moim papierowym notatniku każdy eksperyment jest zbiorem kolejnych stron, ponieważ zbyt trudno było mi śledzić poszczególne eksperymenty, jeśli były mieszane z innymi. Jeśli robię wiele eksperymentów na raz, zostawiam pustą przestrzeń między moimi zapisami dla nich tak, że wszystkie moje notatki i protokoły dotyczące indywidualnego eksperymentu są ciągłe, nawet w przypadku eksperymentów wielodniowych. Szczegóły naprawdę robią lub łamią notatnik, więc staram się być zwięzły, a jednocześnie zawierać jak najwięcej istotnych szczegółów.
– Kitaoka

mówię moim uczniom, że nie muszą przestrzegać określonego formatu w swoim papierowym notatniku, o ile informacje są tam wszystkie i łatwe do znalezienia. Niech zapiszą, co się da, zanim zaczną eksperyment. Polecam im również nagrywanie procedury, ponieważ często przypadkowo chybią lub robią kroki poza kolejnością, a to jest ważne, aby nagrywać. Ich pierwsze eksperymenty będą prawdopodobnie wymagały wielu szczegółów na temat konfiguracji i wykonania procedury – podczas gdy po ich doświadczeniu będą musieli tylko odnotować odpowiednie zmienne. Nigdy nie powinny nagrywać oddzielnych notatek do skopiowania później, ponieważ nieuchronnie prowadzi to do utraty informacji.
– Danielle Solano, profesor nadzwyczajny i kierownik Katedry Chemii i Biochemii na California State University w Bakersfield

jedną z najtrudniejszych rzeczy w utrzymaniu zeszytu laboratoryjnego jest podjęcie decyzji, kiedy napisać dokładny wpis, a kiedy pobieżny. Zawsze zaczynam od zapisania minimalnej ilości informacji dla każdego eksperymentu. Zazwyczaj obejmuje to datę, czas, lokalizację, parametry protokołu, gdzie przechowywane są dane, a jeśli używam kodu—nazwę skryptu i wersję kodu Github. Następnie, gdy tylko zdam sobie sprawę, że konkretny eksperyment nie jest ślepym zaułkiem, piszę dłuższy raport opisujący cel eksperymentu; hipoteza; Data(y) zbierania danych; linki do danych, Skrypty analityczne, notatki wykonane w dniu zbierania danych i pełny protokół; zdjęcia lub filmy z konfiguracji eksperymentalnej; wyniki; wnioski; i wreszcie kolejne kroki.

trzymam rzeczy w porządku chronologicznym i datuję każdą stronę mojego papierowego Notatnika, a często umieszczam lokalizację, gdzie zrobiłem eksperyment lub napisałem swoje notatki. Jeśli zapiszę coś do notatnika, podpisuję i datuję na taśmie. Jeśli wrócę i zmienię coś na starej stronie, podpisuję i datuję zmianę. W przypadku mojego elektronicznego notebooka planuję automatyczne codzienne kopie zapasowe.
– Colucci

po rozpoczęciu mojego pierwszego eksperymentu dnia, stworzyłem notatkę na Evernote z datą i dodałem do niej, robiąc migawki z moich notatek z długopisu i papieru w laboratorium, a później organizując dodatkowe notatki w aplikacji. Pod koniec każdego dnia poświęcałem 15 minut na przeczytanie mojego wpisu i sformułowanie wszystkiego, co było niejasne, ponieważ zapisałem go zbyt szybko, załadowałem dodatkowe zdjęcia lub analizy i dodałem kilka końcowych przemyśleń. Na zakończenie dodam odpowiednie tagowanie.
– Ferro

mój notebook ma dwie główne sekcje-jedną dla dopracowanych protokołów, które złożyłem po kilkukrotnym wykonaniu nowego eksperymentu, a drugą dla moich zapisów eksperymentu. W tej drugiej sekcji zapisuję notatki i obserwacje na Makulaturze, podczas gdy przeprowadzam eksperymenty i wprowadzam informacje do mojego e-notebooka później w bardziej zorganizowany sposób. Wypełnianie notatnika laboratoryjnego po przeprowadzeniu wyczerpującego i złożonego eksperymentu może być bardzo denerwujące, ale może to być najbardziej krytyczny czas! Na te dni, kiedy naprawdę muszę to odłożyć, trzymam część biurka na notatki eksperymentalne, które mogę następnie wykorzystać do aktualizacji notatnika następnego dnia.
– Bartman

jeszcze jakieś rady?

Gorąco polecam korzystanie z początku własnego doświadczenia badawczego jako okresu próbnego dla metod notebooka laboratoryjnego, aby znaleźć podejście, które działa dla Ciebie. Główne kryteria to to, że jest prosty i wygodny w użyciu i łatwy do tworzenia kopii zapasowych. Mimo to żadna pojedyncza metoda nie jest idealna, więc ogranicz się do wypróbowania trzech lub czterech narzędzi. Przekonałem się na własnej skórze, że wadą eksperymentowania z wieloma różnymi narzędziami jest to, że Twoje dane są rozproszone wśród notebooków, co może sprawić, że znalezienie tego, czego szukasz, będzie bardzo trudne.
– Colucci

oprócz prób i błędów, nauczyłem się, co powinno znaleźć się w moich notatkach, czytając Zeszyty byłych członków laboratorium i zastanawiając się, co w opisie ułatwiło lub utrudniło odtworzenie eksperymentu. Brak informacji może być bardzo frustrujący, a ja chcę, aby wszelkie dalsze działania moich eksperymentów były tak płynne, jak to możliwe.
– Kitaoka

pod warunkiem, że nie łamiesz żadnych zasad, nie bój się rozwijać własnego sposobu robienia notatek. Jedna z odwiedzanych przeze mnie instytucji miała swoje wytyczne, ale ponieważ moje indywidualne podejście do sprawy mi odpowiadało, postanowiłam je kontynuować i raz w tygodniu przekładać na zgodny ze standardami zeszyt. To może wydawać się dodatkową pracą, ale dla mnie było to albo robienie tego, albo ryzykowanie, że przestanę konsekwentnie używać mojego notatnika laboratoryjnego, co byłoby większą stratą dla mnie, mojego laboratorium, a nawet dla instytucji.

może to najpierw wydawać się obowiązkiem, ale śledzenie tego, co robisz, może być świetnym podniesieniem nastroju. Projekt badawczy składa się z wielu eksperymentalnych wzlotów i upadków, ale głównie upadków, więc uczucie odrobiny niebieskiego i bezużytecznego jest bardzo powszechne. Patrząc wstecz na swój notebook pozwala spojrzeć na rzeczy z perspektywy i uświadomić sobie, jak wiele faktycznie osiągasz.
– Ferro