How to keep a lab notebook

Where did I put that Paper? Milloin tein sen kokeen? Minne tallennin sen tiedoston? Jos usein löytää itsesi etsivät kriittistä tietoa olet jotted alas kuin suoritit kokeen, yrittää muistaa, kun teit mitä, tai pesu kiintolevylle löytää oikea tiedosto, se voi olla aika tarkistaa, miten pidät tutkimus muistiinpanoja. Työskenteletpä sitten penkillä, kentällä tai teoriassa, sinun on pidettävä kirjaa siitä, mitä teet, jotta sinä—ja muut—voit palata siihen aina, kun se on tarpeen.

perinteisen paperisen muistikirjan lisäksi on olemassa useita työkaluja, joiden avulla tutkijat voivat dokumentoida työnsä ja edistymisensä, mutta hyvän muistikirjan säilyttämistä opetetaan harvoin. Monilla tutkimuslaitoksilla, rahoittajilla ja ammattijärjestöillä on vaatimuksia tai ne tarjoavat ohjeita. Mutta sen lisäksi, että varmistat, ettet riko mitään sääntöjä, usein on tilaa luovuudelle ja henkilökohtaisille mieltymyksille—edellyttäen, että notetaking on tehokas. Science Careers pyysi eri tieteenalojen ja uravaiheiden tutkijoita jakamaan heille toimivia vinkkejä ja strategioita. Heidän vastauksiaan on muokattu selkeyden ja lyhyyden vuoksi.

tutkimusvihkon pitäminen nähdään usein urakkana. Miksi on tärkeää omistaa siihen riittävästi aikaa ja vaivaa?

Laboratoriokirjat ovat kuin hammaslääkäriin menemistä—kukaan ei nauti siitä, mutta jos et tee sitä, kaikki hampaasi putoavat pois. Lab-muistikirjat ovat hyödyllisin resurssi, jonka voit luoda itse laboratoriossa, ja hyvän luominen vaatii hieman vaivaa joka päivä. Kun totut tottumukseen ja sinulla on järjestelmä, josta pidät, siitä tulee vähemmän työlästä.
– Caroline Bartman, kvantitatiivisen metabolomiikan tutkijatohtori Princetonin yliopistosta

lab notebook pitää kirjaa kaikista tutkimuksistani ja kaikista epäonnistumisistani ja optimoinneistani. Se on loistava työkalu jäykkyyden ja toistettavuuden ylläpitämiseen-jos en muista, miten tein kokeen tai miten analysoin TIEDOT, kaikki tämä tieto on muistikirjassani. Se tekee myös niin paljon helpompaa tulevaisuuden lab kaverit, jotka saattavat joutua tekemään samanlaisen kokeen ja haluavat nähdä, mitä olet jo kokeillut.
– Maiko Kitaoka, molekyyli-ja solubiologian tohtorikoulutettava Kalifornian yliopistossa, Berkeleyssä

, jolla oli ahkera kokemus kokeellisista vaiheistani, auttoi minua ymmärtämään tiettyjä tuloksia. Se, mitä tiettynä päivänä tapahtui, voi antaa viitteitä siitä, ovatko jotkin tiedot poikkeavia ympäristötekijöiden, kuten lämpötilan muutoksen vuoksi. Ajan myötä myös lab-muistikirjani kehittyi työkaluksi, jolla voi seurata ideoitani. Et ehkä halua muuttaa suunnittelua tai menetelmää keskellä kokeilua, mutta muistikirja on täydellinen paikka huomata, mitä haluat kokeilla seuraavaksi.
– Valentina Ferro, Ft.- holder in experimental physics and freelance science illustrator Seattlessa, Washingtonissa

in a theoretical field like mine, a notebook is essential for keeping track of my companies to solve a problem. Ilman hyvin kirjoitettuja muistiinpanoja tekisin todennäköisesti samat laskelmat monta kertaa. Muistikirja on hyödyllinen myös lähestymistapojeni ja tuloksieni jakamiseen yhteistyökumppaneiden kanssa.
– Matteo Falessi, plasmafysiikan tutkijatohtori Enea Frascati-tutkimuskeskuksessa Italiassa

paluu vanhaan dataan ilman vahvaa dokumentaatiota voi olla vähän kuin arkeologinen tutkimusretki. Hyvä muistikirja mahdollistaa nopeasti nähdä, mitä kokeita tehtiin ja millä tavoitteilla, uudelleenarvioida vanhoja tietoja uusien havaintojen valossa, ja poimia työtä, johon jätit sen. Laajemmin ottaen hyvät muistiinpanot mahdollistavat tutkimuksen toistettavuuden, tarjoavat kirjallisia todisteita siitä, että kaikki on tehty selkeällä, avoimella ja eettisellä tavalla, ja tarjoavat perustelut sille, miksi tietyt tutkimusvalinnat on tehty.
– Caroline Lynn Kamerlin, Rakennebiologian professori Uppsalan yliopistosta Ruotsista

jos kirjoitat paperille kuukausia tai jopa vuosia kokeiden päättymisen jälkeen, laboratorion muistikirjassasi on kaikki tiedot, joita tarvitset kuvaillaksesi tarkasti menetelmäsi ja tuloksesi. Jossain vaiheessa uraasi saatat myös joutua käyttämään sitä todistaaksesi, että idea todella oli ”sinun” tai vaatiaksesi immateriaalioikeuttasi. Lisäksi tieteellisten väärinkäytösten tapauksessa laboratorion muistikirja on välttämätön osa tutkimusta. Lopulta labran muistikirja toimii urasi tilikirjana ja siitä tulee osa perintöäsi tiedemiehenä. Älä laiminlyö sitä!
– Jeremy C. Borniger, neurotieteen tutkijatohtori Stanfordin yliopistosta Palo Altosta, Kaliforniasta

käytätkö perinteistä paperista muistikirjaa, digitaalisia työkaluja vai niiden yhdistelmää?

tykkään käyttää käsin kirjoitettua vihkoa, vaikka suurin osa tuottamastani datasta on digitaalista. Olen myös joskus tallentaa teknisiä yksityiskohtia—kuten erityisiä Hankinta Asetukset mikroskoopit tai mitkä kokeet yhdistin yhteen tehdä luku-tekstitiedostoja, joista voin helpoimmin löytää ne. Yksi haaste perinteisessä paperisessa muistikirjassa on kuitenkin se, että se ei ole aina helposti haettavissa, joten käytän ensimmäisiä sivuja sisällysluettelon ylläpitämiseen ja vertailen digitaalisia tiedostojani mahdollisimman usein.
– Kitaoka

elektronisen laboratorion muistikirja on mielestäni niin paljon parempi kuin paperinen. Se on haettavissa, joten voin helposti hakea kirjaa kokeista tein vuosia sitten tai kammata sen läpi löytää keskeisiä yksityiskohtia. En koskaan tuhoa sitä nostamalla vahingossa etanolilasi. Niin kauan kuin sitä tukee, häviäminen on mahdotonta. Lisäksi minun täytyy täyttää se työpöytäni ääressä ilman hanskoja, mikä pakottaa minut varaamaan sille aikaa.
– Bartman

olen käyttänyt paperista muistikirjaa tutkijanurani alusta asti, mutta ajan myötä olen joutunut muokkaamaan strategiaani eksyessäni kaikille noille sivuille. Tänään käytän labran muistikirjaani vain kirjoittaakseni ylös pikaviestejä. Kaikki optimoidut protokollat, raakadata ja analyysit tallennetaan tietokoneelle. Vertailen muistikirjan merkintöjä ja tiedostoja käyttäen päivämäärää ja lyhyttä kuvausta jokaisesta kokeesta. Lisäksi minusta on hyödyllistä pitää erillistä tutkimusvihkoa laajempia asioita varten, kuten kokeen käsitteellistäminen, käsikirjoituksen laatiminen, kokouksen järjestäminen tai muistiinpanojen tekeminen konferenssissa.
– Karine Salin, pysyvä ympäristöfysiologian tutkija Ifremerissä Plouzanéssa, Ranskassa

saan enemmän ideoita paperilla, joten aluksi halusin perinteisen muistikirjan hinnalla millä hyvänsä. Mutta olin työskennellyt useita projekteja ja tarvitsin minun muistikirja on haettavissa ja taggable seurata helpommin. Sweet spot for me was using a digital notebook like Evernote with the capability to include snapshots of traditional pen and paper notes, as well as the coding scripts and other digital files and images I created. Lisäksi, ottaa sovellus puhelimessani tarkoitti, että voisin tallentaa äänimerkinnät kävellessäni, jos sain idean halusin kokeilla myöhemmin. Digitaalisen muistikirjan avulla on kuitenkin lähes mahdotonta löytää unohtamiaan asioita kuin vain selailemalla paperisen muistikirjan sivuja. Voitin ongelman tägäämällä mitä oli hieman vähemmän merkitystä kokeiluja – esimerkiksi, liity ideoita ja lisäkysymyksiä jatkaa—tag ”random” niin, että aina silloin tällöin voisin selata niitä etsimään inspiraatiota.
– Ferro

paperinen muistikirja riittää suurimmalle osalle töistäni. Kuitenkin, varmistan luoda digitaalisen varmuuskopion kaikista muistiinpanoja ottamalla kuvan käyttämällä Genius Scan app tai kirjallisesti ne ylös Microsoft Word. Minulla on myös tietokonekansio, johon tallennan kaikki vakioprotokollani, jotta voin yksinkertaisesti viitata niihin sen sijaan, että kirjoittaisin koko jutun muistikirjaani joka kerta, kun teen kokeen. Lisäksi minulla on erilliset merkityt kansiot jokaiselle työlinjalle, johon laitan muistiinpanoja ja tietoja, jotka eivät sovi helposti muistikirjaan, kuten Microsoft Excel-tulosteet, graafiset tiedot, sopimukset ja materiaalin siirtosopimukset.
– borniger

kirjoitan digitaalisen muistikirjani Org-moodilla, merkintäkielellä, joka on suunniteltu erityisesti käsinkirjoitettujen kuvien, kuten tulosten, laskelmien, yhtälöiden, taulukoiden, bibliografioiden ja jopa koodinpätkien, syöttämiseen helposti. Muistikirja itsessään koostuu useista linkitetyistä tekstitiedostoista, joten kun minulla on paperi kirjoitettavana, voin helposti käyttää tekstitiedostoja luonnoksina viemällä ne LaTeX-tiedostoon.
– Falessi

käytän pääasiassa sähköistä vihkoa, mutta usein laboratoriossa kirjoitan muistiinpanoni ensin paperiseen vihkoon—en koskaan paperinpalaseen—ja sitten skannaan myös paperisen vihkoni niin, että pääsen käsiksi sen sisältöön milloin tahansa. Käytän Confluence varten sähköinen ennätys, mutta Microsoft OneNote on toinen hyvä vaihtoehto, koska voit käyttää sitä offline ja verkossa ja se on ilmainen. Ristiviittaan käyttäen sivunumeroita paperisesta muistikirjastani ja päivämääriä ja kokeilujen nimiä tiedostonimissäni. Kaikki minun protokollat ovat minun digitaalinen muistikirja-usein kuvia minun kokeellinen asetelmia, materiaalia, laitteet, ja joskus videotallenne minusta puhuu läpi jokaisessa vaiheessa protokollan. Tallennan raakadatani laboratorioni palvelimelle ja varmuuskopioin ne pilveen ja kovalevylle. Koodini tietojen käsittelyyn ja analysointiin on GitHubissa, suositussa ohjelmistoversiojärjestelmässä. Lopuksi pidän tehtävälistaa sähköisessä muistikirjassani, joka toimii myös kirjauksena siitä, mitä olen saavuttanut joka viikko.
– Lina Colucci, terveystieteiden ja teknologian tutkimusyhtiö Massachusetts Institute of Technologyssa Cambridgessa ja data science consulting yrittäjä San Franciscon Bay Areassa

mitä strategioita käytät pitääksesi muistikirjasi järjestyksessä, täydellisenä ja parhaiden käytäntöjen mukaisesti?

minulle se, mikä toimii, on suhtautua notetakingiin tärkeänä kokeellisena askeleena. Yleensä kirjoitan asioita ylös, Kun menen pitkin, joskus kirjallisesti protokollan tai mitä olen aikeissa tehdä ennen kokeilun aloittamista ja sitten muokkaamalla jotain, mitä tein toisin kuin oli suunniteltu. Näin laboratorion muistikirjan pitäminen muistuttaa ruoanlaittoa, jossa koko prosessin ajan siivoaminen on paljon helpompaa kuin loppuun asti odottaminen, kun astiat kasataan kattoon. Laboratorion muistikirjan täyttäminen mahdollisimman pian vähentää myös mahdollisuuksia unohtaa tärkeä tieto tai ottaa käyttöön virhe.

paperivihkoni järjestelyn suhteen noudatan vain aikajärjestystä, joten jokainen sivu on uusi päivä (Ellen käytä useita sivuja päivässä). Pidän huolen siitä, että kirjoitan yksityiskohtaisen kuvauksen siitä, mitä tein, miksi ja miten preesensissä; päivämäärä, kellonaika ja paikka, jolloin työ tehtiin; kaikkien muiden nimet, joiden kanssa tein työtä; erityiset olosuhteet, jotka sattuivat työn aikana (esimerkiksi oliko palohälytys, joka olisi voinut vaikuttaa tuloksiin?) ja allekirjoitukseni ja mahdollisuuksien mukaan todistajanmerkintäni (yleensä päätutkijani tai laboratoriokaverini). Kaikki tämä pitäisi kirjoittaa kynällä, ja jos jokin oli virhe, älä ylitä sitä kokonaan, vaan laita vain yksi rivi sen läpi, jotta se voidaan vielä lukea. Ideoiden kirjoittaminen muistiin (metodologian sijaan) on myös hyväksyttävää ja kannustavaa.
– Borniger

paperisessa muistikirjassani jokainen koe on peräkkäisten sivujen Rykelmä, koska minulle kävi liian vaikeaksi seurata yksittäisiä kokeita, jos ne sekoitettiin muihin. Jos teen useita kokeita kerralla, jätän tyhjää tilaa minun kirjaa heille niin, että kaikki minun muistiinpanoja ja protokollia koskevat yksittäisen kokeen ovat jatkuvia, jopa monipäiväinen kokeita. Yksityiskohdat todella tekevät tai rikkovat muistikirjan, joten yritän olla ytimekäs ja sisällyttää mahdollisimman paljon asiaan liittyviä yksityiskohtia.
– Kitaoka

kerron oppilailleni, ettei heidän tarvitse noudattaa tiettyä muotoa paperisessa muistikirjassa, kunhan kaikki tieto on siellä ja helppo löytää. Käsken heitä kirjoittamaan kaiken mahdollisen ennen kokeen aloittamista. Ohjeistan heitä myös tallentamaan toimenpiteen, koska he usein vahingossa missaavat tai tekevät askelia epäjärjestyksessä, ja se on tärkeää tallentaa. Heidän ensimmäiset kokeet todennäköisesti vaativat paljon yksityiskohtia siitä, miten perustaa ja suorittaa menettely—kun taas kun ne ovat kokeneet, ne tarvitsee vain huomata asiaankuuluvat muuttujat. Niiden ei pitäisi koskaan tallentaa erillisiä muistiinpanoja kopioida myöhemmin, koska väistämättä tämä johtaa menetetty tietoja.
– Danielle Solano, apulaisprofessori ja kemian ja biokemian laitoksen puheenjohtaja California State Universityssä Bakersfieldissä

yksi vaikeimmista asioista laboratorion muistikirjan ylläpitämisessä on päättää, milloin kirjoittaa perusteellinen merkintä ja milloin kirjoittaa pintapuolinen. Aloitan aina kirjoittamalla ylös vähimmäismäärän tietoa jokaisesta kokeesta. Tämä sisältää yleensä päivämäärän, kellonajan, sijainnin, protokollaparametrit, johon tiedot tallennetaan, ja—jos käytän koodia—komentosarjan nimen ja Github-koodiversion. Sitten, heti kun tajuan, että tietty kokeilu ei ole umpikuja, kirjoitan pitempi raportti kuvataan tavoite kokeen; hypoteesi; päivämäärä(t) tietojen keruu; linkkejä tietoihin, analyysi skriptit, muistiinpanot päivänä tiedonkeruu, ja koko protokolla; kuvia tai videoita kokeellisen asennuksen; tulokset; päätelmät; ja lopuksi seuraavat vaiheet.

pidän asiat aikajärjestyksessä ja päivitän paperivihkoni jokaisen sivun, ja laitan usein muistiin myös paikan, jossa tein kokeen tai kirjoitin muistiinpanoni. Jos nauhoitan jotain vihkoon, allekirjoitan ja tapailen nauhan poikki. Jos menen takaisin ja muutan jotain vanhalla sivulla, allekirjoitan ja päivitän muutoksen. Minun sähköinen muistikirja, ajoituksen Automatisoitu Päivittäin varmuuskopiot.
– Colucci

aloittaessani päivän ensimmäisen kokeiluni, tein Evernoteen muistilapun, jossa oli päivämäärä, ja lisäsin sitä mennessäni, ottaen valokuvia kynästäni ja paperilapuistani laboratoriossa ja järjestäen myöhemmin lisämuistiinpanoja sovellukseen. Lopussa jokaisen päivän, ottaisin 15 minuuttia lukea minun merkintä ja muotoile uudelleen mitään, joka oli epäselvä, koska kirjoitin sen liian nopeasti, ladata ylimääräisiä kuvia tai analyysejä, ja lisätä joitakin lopullisia ajatuksia. Lopuksi haluaisin lisätä asianmukaiset merkinnät.
– Ferro

muistikirjassani on kaksi kokonaisuutta—toisen viimeistellyille protokollille, jotka kokosin tehtyäni muutaman kerran uuden kokeen, ja toisen koemuistioilleni. Tuota toista osaa varten kirjoitan muistiinpanoja ja havaintoja romupaperille samalla, kun teen kokeita ja syötän tietoja e-muistikirjaani myöhemmin organisoidummin. Se voi olla erittäin ärsyttävää täyttää lab notebook suoritettuaan uuvuttava ja monimutkainen kokeilu, mutta se voi olla kriittisin aika! Niinä päivinä, kun minun todella täytyy lykätä sitä, pidän alue työpöydälläni kokeellisia muistiinpanoja, joita voin sitten käyttää päivittää muistikirjani seuraavana päivänä.
– Bartman

muita neuvoja?

suosittelen käyttämään Oman tutkimuskokemuksen alkua koejaksona lab notebook-menetelmille, jotta löytäisit itsellesi sopivan lähestymistavan. Tärkeimmät kriteerit ovat, että se on suoraviivainen ja kätevä käyttää ja helppo varmuuskopioida. Ottaa sanoi, että mikään yksittäinen menetelmä on täydellinen, joten rajoittaa itsesi yrittää kolme tai neljä työkalua. Opin kantapään kautta, että haittapuolena kokeilemalla joukko erilaisia työkaluja on, että tietosi on hajallaan muistikirjoja, mikä voi tehdä siitä erittäin haastavaa löytää mitä etsit.
– Colucci

yrityksen ja erehdyksen lisäksi opin, mitä muistiinpanoihini pitäisi mennä lukemalla entisten laboratorion jäsenten muistikirjoja ja selvittämällä, mikä kuvauksessa teki kokeesta helpomman tai vaikeamman jäljentää. Tiedon puute voi olla hyvin turhauttavaa, ja haluan tehdä kaikki seuranta minun kokeiluja mahdollisimman sujuvaa.
– Kitaoka

jos et riko mitään sääntöjä, älä pelkää kehittää omaa tapaasi tehdä muistiinpanoja. Yhdellä vierailemallani instituutiolla oli omat ohjeensa, mutta koska henkilökohtainen lähestymistapani toimi minulle, päätin jatkaa sitä ja kääntää työni yhdenmukaiseksi muistikirjaksi kerran viikossa. Se voi tuntua ylimääräistä työtä, mutta minulle, se oli joko tehdä tätä tai riskeerata, että voisin lopettaa käyttää minun lab notebook johdonmukaisesti, mikä olisi ollut suurempi menetys minulle, minun lab, ja jopa laitoksen.

se voi aluksi tuntua urakalta, mutta se, että pitää kirjaa tekemisistään, voi piristää tunnelmaa. Tutkimushanke koostuu monista kokeellisista ylä-ja alamäistä, mutta enimmäkseen alamäistä, joten tunne hieman sininen ja hyödytön on hyvin yleistä. Muistikirjaasi katsellessasi voit asettaa asiat oikeisiin mittasuhteisiin ja ymmärtää, kuinka paljon todella saavutat.
– Ferro