Hoe houd ik een labo notebook

Waar heb ik dat stuk papier gelaten? Wanneer heb ik dat experiment gedaan? Waar heb ik dat gegevensbestand opgeslagen? Als u vaak op zoek bent naar een kritisch stukje informatie die u noteerde terwijl u uw experiment hebt uitgevoerd, probeert te onthouden wanneer u wat hebt gedaan of uw harde schijf schuurt om het juiste bestand te vinden, is het misschien tijd om opnieuw te bekijken hoe u uw onderzoeksnotities bewaart. Of je nu werkt op de bank, in het veld, of in theorie, je moet bijhouden wat je doet, zodat u—en anderen—kan verwijzen naar het wanneer dat nodig is.

er zijn naast het traditionele papieren notitieboekje meerdere hulpmiddelen beschikbaar om wetenschappers te helpen hun werk en vooruitgang te documenteren, maar hoe een goed notitieboekje te bewaren wordt zelden geleerd. Veel onderzoeksinstellingen, financieringsorganen en beroepsverenigingen hebben eisen of bieden richtlijnen aan. Maar afgezien van ervoor te zorgen dat u geen regels overtreedt, is er vaak ruimte voor creativiteit en persoonlijke voorkeur—op voorwaarde dat de notetaking effectief is. Science Careers vroeg onderzoekers uit verschillende disciplines en loopbaanfasen om de tips en strategieën te delen die voor hen werken. Hun antwoorden zijn bewerkt voor duidelijkheid en beknoptheid.

het bijhouden van een research notebook wordt vaak gezien als een karwei. Waarom is het belangrijk om er voldoende tijd en moeite aan te besteden?

Lab notebooks zijn als naar de tandarts gaan—niemand vindt het leuk, maar als je het niet doet vallen al je tanden eruit. Lab notebooks zijn de meest nuttige bron die je kunt maken voor jezelf in het lab, en het maken van een goede één vereist een beetje inspanning elke dag. Zodra je in de gewoonte en hebben een systeem dat je wilt, het wordt minder belastend.
– Caroline Bartman, postdoctoraal fellow in quantitative metabolomics aan Princeton University

My lab notebook houdt al mijn onderzoeksexperimenten en al mijn mislukkingen en optimalisaties bij. Het is een geweldig hulpmiddel voor het handhaven van rigor en reproduceerbaarheid-als ik niet meer weet hoe ik een experiment deed of hoe ik de gegevens geanalyseerd, al die informatie is in mijn notebook. Het maakt het ook zo veel gemakkelijker voor uw toekomstige labgenoten die mogelijk een soortgelijk experiment moeten doen en willen zien wat u al hebt geprobeerd.
– Maiko Kitaoka, ph. d. kandidaat in moleculaire en celbiologie aan de University of California, Berkeley

het hebben van een zorgvuldig verslag van mijn experimentele stappen hielp me om bepaalde resultaten te begrijpen. Het opmerken van wat er op een bepaalde dag is gebeurd, kan u een indicatie geven of sommige gegevens uitschieters zijn vanwege omgevingsfactoren zoals een temperatuurverandering. Na verloop van tijd, mijn lab notebook ook uitgegroeid tot een hulpmiddel om bij te houden van mijn ideeën. U wilt misschien niet uw ontwerp of methode te veranderen in het midden van een experiment, maar uw notebook is de perfecte plek om op te merken wat u wilt proberen volgende.
– Valentina Ferro, Ph. D.- houder in experimentele natuurkunde en freelance science illustrator in Seattle, Washington

in een theoretisch veld als het mijne is een notebook essentieel voor het bijhouden van mijn pogingen om een probleem op te lossen. Zonder goed geschreven notities zou ik waarschijnlijk dezelfde berekeningen vele malen doen. Een notebook is ook handig voor het delen van mijn benaderingen en resultaten met medewerkers.
– Matteo Falessi, postdoctoraal onderzoeker plasmafysica aan het Enea Frascati Research Centre in Italië

terugkomen op oude gegevens zonder sterke documentatie kan een beetje lijken op een archeologische expeditie. Een goede notebook maakt het mogelijk om snel te zien welke experimenten werden gedaan en met welke doelen, herevalueren oude gegevens in het licht van nieuwe bevindingen, en pak het werk waar je het liet. Meer in het algemeen, goede notities toestaan onderzoek reproduceerbaarheid; bieden schriftelijk bewijs dat alles werd gedaan in een duidelijke, transparante en ethische manier; en bieden rechtvaardiging voor de reden waarom bepaalde onderzoekskeuzes werden gemaakt.
– Caroline Lynn Kamerlin, hoogleraar structurele biologie aan de Universiteit van Uppsala in Zweden

als u maanden of zelfs jaren na de voltooiing van de experimenten een papier aan het schrijven bent, zal uw laboratoriumboekje alle details bevatten die u nodig hebt om uw methoden en resultaten nauwkeurig te beschrijven. Op een gegeven moment in je carrière, kan het ook nodig zijn om het te gebruiken om bewijs te leveren dat een idee echt “van jou” was of om aanspraak te maken op je intellectuele eigendom. Bovendien, in het geval van wetenschappelijke wangedrag beschuldigingen, uw lab notebook zal een onmisbaar element in het onderzoek. Uiteindelijk zal het lab notebook fungeren als uw carrière grootboek en deel uitmaken van uw nalatenschap als wetenschapper. Verwaarloos het niet!
– Jeremy C. Borniger, Postdoctoral fellow in neuroscience aan Stanford University in Palo Alto, Californië

gebruikt u een traditioneel notitieboekje, digitale hulpmiddelen of een combinatie?

Ik gebruik graag een handgeschreven notitieboekje, ook al zijn de meeste gegevens die ik produceer digitaal. Ik registreer ook af en toe technische details—zoals specifieke acquisitie—instellingen op microscopen of welke experimenten ik samengevoegd om een figuur te maken-in tekstbestanden waar ik ze het gemakkelijkst kan vinden. Een uitdaging met een traditioneel papieren notitieboekje is echter dat het niet altijd gemakkelijk doorzoekbaar is, dus gebruik ik de eerste paar pagina ‘ s om een inhoudsopgave bij te houden en zoek ik zo vaak mogelijk naar mijn digitale databestanden.
– Kitaoka

ik vind een elektronisch notitieboekje zoveel beter dan een papieren notitieboekje. Het is doorzoekbaar, dus ik kan gemakkelijk op te halen records van experimenten die ik deed jaren geleden of kam door het om de belangrijkste details te vinden. Ik zal het nooit vernietigen door per ongeluk een beker ethanol op te sturen. En, zolang je het back-up, het is onmogelijk om te verliezen. Plus, ik moet het invullen op mijn bureau zonder handschoenen aan, wat me dwingt om er wat tijd voor te maken.
– Bartman

sinds het begin van mijn onderzoekscarrière heb ik een papieren notitieboekje gebruikt, maar na verloop van tijd heb ik mijn strategie moeten aanpassen omdat ik verdwaald raakte in al die pagina ‘ s. Vandaag, gebruik ik mijn lab notebook alleen om snel notities te noteren als ik ga. Al mijn geoptimaliseerde protocollen, ruwe data en analyses worden opgeslagen op de computer. Ik vergelijk mijn notitieboekjes en computerbestanden met behulp van de datum en een korte beschrijving van elk experiment. Daarnaast vind ik het nuttig om een apart onderzoek notebook te houden voor bredere kwesties zoals het conceptualiseren van een experiment, het opstellen van een manuscript, het organiseren van een vergadering, of het nemen van aantekeningen op een conferentie.
– Karine Salin, permanent Research fellow in environmental physiology aan IFREMER in Plouzané, Frankrijk

ik krijg meer ideeën op papier, dus in eerste instantie wilde ik koste wat het kost een traditioneel Schrift hebben. Maar ik werkte aan verschillende projecten en ik moest mijn notebook doorzoekbaar en taggable te houden gemakkelijker. De sweet spot voor mij was het gebruik van een digitale notebook zoals Evernote met de mogelijkheid om snapshots van traditionele pen en papier notities, evenals de codering scripts en andere digitale bestanden en afbeeldingen die ik gegenereerd. Bovendien, met de app op mijn telefoon betekende dat ik kon voice notes opnemen tijdens het lopen als ik kreeg een idee dat ik wilde later proberen. Met een digitaal notitieboekje is het echter bijna onmogelijk om dingen te vinden die je vergeten bent zoals je zou doen door gewoon door de pagina ‘ s van je papieren notitieboekje te bladeren. Ik overwon het probleem door te taggen wat iets minder relevant was voor de experimenten—bijvoorbeeld, ongerelateerde ideeën en verdere vragen om na te streven—met de tag “random”, zodat ik ze zo nu en dan kon bladeren op zoek naar inspiratie.
– Ferro

een papieren notitieboekje volstaat voor het grootste deel van mijn werk. Echter, Ik zorg ervoor dat een digitale back-up van alle notities te maken door het nemen van een foto met behulp van de Genius Scan app of het schrijven van hen in Microsoft Word. Ik heb ook een computer map waar ik al mijn standaard protocollen op te slaan, zodat ik ze gewoon kan verwijzen in plaats van het schrijven van de hele zaak in mijn notebook elke keer als ik een experiment doen. Daarnaast heb ik aparte gelabelde binders voor elke lijn van het werk waar ik notities en gegevens die niet gemakkelijk passen in de notebook, zoals Microsoft Excel printouts, grafische gegevens, contracten, en materiaal overdracht overeenkomsten.
– Borniger

ik schrijf mijn digitale notebook in de Org-modus, een opmaaktaal die speciaal is ontworpen om eenvoudig handgeschreven afbeeldingen zoals resultaten, berekeningen, vergelijkingen, tabellen, bibliografieën en zelfs stukjes code in te voegen. De notebook zelf bestaat uit verschillende gekoppelde platte tekstbestanden, dus als ik een papier moet schrijven, kan ik de tekstbestanden gemakkelijk als Concepten gebruiken door ze te exporteren naar een LaTeX-bestand.
– Falessi

Ik gebruik voornamelijk een elektronisch notitieboekje, maar vaak schrijf ik in het lab eerst mijn notities in een papieren notitieboekje—nooit een stukje papier—en dan scan ik ook mijn papieren notitieboekje zodat ik altijd toegang heb tot de inhoud. Ik gebruik Confluence voor de elektronische record, maar Microsoft OneNote is een andere goede optie als je het offline en online kunt gebruiken en het is gratis. Ik kruisverwijzing met behulp van paginanummers uit mijn papieren notitieboekje en data en namen van de experimenten in mijn bestandsnamen. Al mijn protocollen zijn in mijn digitale notebook—vaak met foto ‘ s van mijn experimentele opstellingen, materiaal, apparatuur, en soms een video-opname van mij praten door elke stap van het protocol. Ik sla mijn ruwe gegevens op de server van mijn lab en back-up op de cloud en op een harde schijf. Mijn code voor het verwerken en analyseren van gegevens is op Github, een populair software versiesysteem. Tot slot, Ik houd een to-do lijst in mijn Elektronische notebook, die ook dient als een record van wat ik heb bereikt elke week.
– Lina Colucci, Research affiliate in health sciences and technology aan het Massachusetts Institute of Technology in Cambridge en data science consulting entrepreneur in the San Francisco Bay Area

welke strategieën gebruikt u om uw notebook georganiseerd, compleet en volgens de beste praktijken te houden?

wat voor mij werkt is notetaking als een vitale experimentele stap te behandelen. Ik schrijf meestal dingen op als ik ga langs, af en toe het opschrijven van het protocol of wat ik op het punt om te doen voor het starten van het experiment en vervolgens het bewerken van alles wat ik deed anders dan gepland. Op deze manier, het houden van een lab notebook is vergelijkbaar met koken, waar opruimen gedurende het hele proces maakt het een stuk makkelijker dan wachten tot het einde wanneer gerechten worden opgestapeld aan het plafond. Het zo snel mogelijk invullen van het labo notebook vermindert ook de kans op het vergeten van een essentieel stuk informatie of het introduceren van een fout.

wat de organisatie van mijn notitieboekje betreft, volg ik gewoon de chronologische volgorde, zodat elke pagina een nieuwe dag is (tenzij ik meerdere pagina ‘ s per dag gebruik). Ik zorg ervoor dat ik een gedetailleerde beschrijving van wat ik deed, waarom en hoe in de tegenwoordige tijd; de datum, tijd en locatie dat het werk werd gedaan; de namen van alle anderen met wie ik het werk deed; speciale omstandigheden die zich tijdens het werk hebben voorgedaan (bijvoorbeeld, was er een brandalarm dat de resultaten had kunnen beïnvloeden?); en mijn handtekening en, indien mogelijk, een getuige merk (meestal mijn hoofdonderzoeker of een lab partner). Dit alles moet in pen worden geschreven, en als iets een fout was, niet helemaal doorhalen; gewoon een enkele regel door te zetten, zodat het nog steeds kan worden gelezen. Het opschrijven van ideeën (in plaats van methodologie) is ook aanvaardbaar en aangemoedigd.
– Borniger

in mijn papieren notitieboekje is elk experiment een cluster van opeenvolgende pagina ‘ s, omdat het voor mij te moeilijk werd om individuele experimenten te volgen als ze met andere werden gemengd. Als ik meerdere experimenten tegelijk doe, laat ik lege ruimte tussen mijn records voor hen, zodat al mijn notities en protocollen met betrekking tot een individueel experiment continu zijn, zelfs voor meerdaagse experimenten. Details echt maken of breken de notebook, dus ik probeer beknopt te zijn, terwijl met inbegrip van zo veel relevante details mogelijk.
– Kitaoka

ik vertel mijn leerlingen dat ze geen specifiek formaat in hun papieren notitieboekje hoeven te volgen, zolang de informatie er maar is en gemakkelijk te vinden. Ik laat ze opschrijven wat ze kunnen voordat ze met het experiment beginnen. Ik instrueer ze ook om de procedure op te nemen als ze gaan, omdat ze vaak per ongeluk stappen missen of doen die niet in orde zijn, en dat is belangrijk om op te nemen. Hun eerste experimenten zullen waarschijnlijk veel details vereisen over hoe de procedure op te zetten en uit te voeren—terwijl zodra ze ervaren zijn, hoeven ze alleen de relevante variabelen op te merken. Ze moeten nooit afzonderlijke notities opnemen om later over te kopiëren, omdat dit onvermijdelijk leidt tot verloren informatie.
– Danielle Solano, universitair hoofddocent en voorzitter van de afdeling scheikunde en biochemie aan de California State University in Bakersfield

een van de moeilijkste dingen bij het onderhouden van een lab notebook is beslissen wanneer een grondige inzending en wanneer een vluchtige inzending te schrijven. Ik begin altijd met het opschrijven van een minimale hoeveelheid informatie voor elk experiment. Dit omvat over het algemeen datum, tijd, locatie, protocol parameters, waar de gegevens worden opgeslagen, en—als ik code gebruik—de scriptnaam en GitHub code versie. Dan, zodra ik me realiseer dat een bepaald experiment is niet een doodlopende weg, schrijf ik een langer rapport beschrijven van het doel van het experiment; hypothese; Datum(s) van gegevensverzameling; links naar de gegevens, analyse scripts, notities genomen op de dag van gegevensverzameling, en het volledige protocol; foto ’s of video’ s van de experimentele setup; resultaten; conclusies; en, ten slotte, volgende stappen.

ik houd de dingen in chronologische volgorde en datum elke pagina van mijn papieren notitieboekje, en ik vaak de locatie van waar ik het experiment deed of schreef mijn notities ook. Als ik iets in het notitieboekje plak, teken ik en dateer ik over de tape. Als ik terugga en iets verander op een oude pagina, teken ik en dateer ik de wijziging. Voor mijn Elektronische notebook, plan ik geautomatiseerde dagelijkse back-ups.
– Colucci

bij het starten van mijn eerste experiment van de dag, zou ik een notitie maken op Evernote met de datum en eraan toe te voegen als ik ga, het nemen van snapshots van mijn pen en papier notities in het lab en later het organiseren van aanvullende notities in de app. Aan het einde van elke dag zou ik 15 minuten nemen om mijn inzending te lezen en om het even wat te herformuleren dat onduidelijk was omdat ik het te snel schreef, extra afbeeldingen of analyses upload, en enkele laatste gedachten toevoegt. Ik sluit af met de juiste markering.
– Ferro

mijn notebook heeft twee overkoepelende secties—een voor de verfijnde protocollen die ik heb samengesteld na een paar keer een nieuw experiment en de andere voor mijn experiment records. Voor die tweede sectie, ik noteer notities en observaties op schroot papier, terwijl ik experimenten uit te voeren en voer informatie in mijn e-notebook later op een meer georganiseerde manier. Het kan super vervelend zijn om uw lab notebook in te vullen na het uitvoeren van een vermoeiend en complex experiment, maar dat kan de meest kritieke tijd zijn! Voor die dagen dat ik het echt moet uitstellen, houd ik een gedeelte van mijn bureau voor experimentele notities, die ik dan kan gebruiken om mijn notebook de volgende dag bij te werken.
– Bartman

verder advies?

ik raad ten zeerste aan om het begin van iemands onderzoekservaring te gebruiken als proefperiode voor lab-notebookmethoden om een aanpak te vinden die voor u werkt. De belangrijkste criteria zijn dat het eenvoudig en gemakkelijk te gebruiken en gemakkelijk te back-up. Dat gezegd hebbende, geen enkele methode is perfect, dus beperk jezelf tot het proberen van drie of vier gereedschappen. Ik leerde op de harde manier dat het nadeel van het experimenteren met een heleboel verschillende tools is dat uw gegevens is verspreid onder notebooks, die het zeer uitdagend kan maken om te vinden wat je zoekt.
– Colucci

afgezien van trial and error, leerde ik wat er in mijn notities moest worden opgenomen door de notitieboeken van voormalige lableden te lezen en uit te zoeken wat in de beschrijving een experiment gemakkelijker of moeilijker te reproduceren maakte. Een gebrek aan informatie kan erg frustrerend zijn, en Ik wil elke follow-up van mijn experimenten zo soepel mogelijk te maken.
– Kitaoka

Als u geen regels overtreedt, wees dan niet bang om uw eigen manier van aantekeningen maken te ontwikkelen. Een van de instellingen die ik bezocht had zijn eigen richtlijnen, maar omdat mijn individuele aanpak voor mij werkte, besloot ik ermee door te gaan en mijn werk één keer per week te vertalen naar een compliant notebook. Het lijkt misschien extra werk, maar voor mij, was het ofwel dit doen of riskeren dat ik zou stoppen met het gebruik van mijn lab notebook consequent, wat een groter verlies zou zijn geweest voor mij, mijn lab, en zelfs voor de instelling.

het lijkt op het eerste gezicht misschien een karwei, maar het bijhouden van wat je doet kan een goede stemmingverhoger zijn. Een onderzoeksproject bestaat uit vele experimentele ups en downs, maar meestal downs, dus een beetje blauw en nutteloos voelen is heel gebruikelijk. Terugkijkend op je notebook kun je dingen in perspectief zetten en beseffen hoeveel je eigenlijk bereikt.
– Ferro