hogyan kell tartani a lab notebook

hol tettem, hogy a darab papír? Mikor csináltam ezt a kísérletet? Hová mentettem az adatfájlt? Ha gyakran találja magát egy kritikus információ után, amelyet feljegyzett a kísérlet végrehajtása során, megpróbál emlékezni arra, hogy mikor tett mit, vagy a merevlemezt súrolja a megfelelő fájl megtalálásához, ideje lehet újra megvizsgálni, hogyan tartja meg kutatási jegyzeteit. Függetlenül attól, hogy a padon, a terepen vagy elméletben dolgozik, nyomon kell követnie, hogy mit csinál, hogy Ön—és mások—bármikor visszautalhassanak rá.

a hagyományos papírfüzeteken túl számos eszköz áll rendelkezésre, amelyek segítenek a tudósoknak dokumentálni munkájukat és előrehaladásukat, de a jó jegyzetfüzet vezetését ritkán tanítják. Számos kutatóintézet, finanszírozó testület és szakmai szövetség rendelkezik követelményekkel vagy iránymutatásokkal. De amellett, hogy megbizonyosodik arról, hogy nem szegi meg a szabályokat, gyakran van hely a kreativitásnak és a személyes preferenciáknak—feltéve, hogy a jegyzetelés hatékony. A Science Careers felkérte a kutatókat számos tudományágból és karrierszakaszból, hogy osszák meg a számukra megfelelő tippeket és stratégiákat. Válaszaikat az egyértelműség és a rövidség érdekében szerkesztették.

a kutatási jegyzetfüzet vezetése gyakran házimunkának számít. Miért fontos, hogy elegendő időt és erőfeszítést szenteljünk ennek?

a laboratóriumi Notebookok olyanok, mint a fogorvoshoz menni—senki sem élvezi, de ha nem teszed meg, akkor minden foga kiesik. A laboratóriumi jegyzetfüzetek a leghasznosabb erőforrások, amelyeket a laborban létrehozhat magának, és egy jó létrehozása minden nap egy kis erőfeszítést igényel. Miután megszokta a szokást, és van egy olyan rendszere, amely tetszik, kevésbé megterhelő.
– Caroline Bartman, a Princetoni Egyetem kvantitatív metabolomika posztdoktori munkatársa

a laboratóriumi jegyzetfüzetem nyomon követi minden kutatási kísérletemet, minden kudarcomat és optimalizálásomat. Ez egy nagyszerű eszköz a szigor és a reprodukálhatóság fenntartására—ha nem emlékszem, hogyan végeztem egy kísérletet, vagy hogyan elemeztem az adatokat, az összes információ a notebookomban van. Ez sokkal könnyebbé teszi a jövőbeli laboratóriumi társait is, akiknek hasonló kísérletet kell végezniük, és meg akarják nézni, amit már kipróbáltak.
– Maiko Kitaoka, Ph.D. jelölt molekuláris és sejtbiológia a University of California, Berkeley

miután egy szorgalmas rekord az én kísérleti lépések segített megérteni bizonyos eredményeket. Figyelembe véve, hogy mi történt egy adott napon, jelezheti, hogy egyes adatok kiugróak-e a környezeti tényezők, például a hőmérsékletváltozás miatt. Idővel a laboratóriumi jegyzetfüzetem is olyan eszközzé fejlődött, amely nyomon követi ötleteimet. Lehet, hogy nem akarja megváltoztatni a tervét vagy a módszerét egy kísérlet közepén, de a notebook tökéletes hely arra, hogy megjegyezze, mit szeretne legközelebb kipróbálni.
– Valentina Ferro, Ph. D.- holder kísérleti fizika és szabadúszó tudományos illusztrátor Seattle-ben, Washington

egy olyan elméleti területen, mint az enyém, a jegyzetfüzet elengedhetetlen a probléma megoldására tett kísérleteim nyomon követéséhez. Jól megírt jegyzetek nélkül valószínűleg sokszor elvégezném ugyanazokat a számításokat. A jegyzetfüzet arra is hasznos, hogy megosszam a megközelítéseimet és az eredményeimet az együttműködőkkel.
– Matteo Falessi, az olaszországi ENEA Frascati Kutatóközpont Plazmafizikai posztdoktori kutatója

a régi adatokhoz való visszatérés erős dokumentáció nélkül kissé olyan lehet, mint egy régészeti expedíció. Egy jó jegyzetfüzet lehetővé teszi, hogy gyorsan lássuk, milyen kísérleteket végeztek és milyen célokkal, átértékeljük a régi adatokat az új eredmények fényében, és felvegyük a munkát, ahol hagytuk. Tágabb értelemben a jó jegyzetek lehetővé teszik a kutatás reprodukálhatóságát; írásos bizonyítékot szolgáltatnak arról, hogy minden világos, átlátható és etikus módon történt; és indokolást nyújtanak arra, hogy miért hoztak bizonyos kutatási döntéseket.
– Caroline Lynn Kamerlin, a svédországi Uppsalai Egyetem strukturális biológia professzora

ha hónapokkal vagy akár évekkel a kísérletek befejezése után ír egy papírt, a laboratóriumi jegyzetfüzet tartalmazza az összes szükséges részletet a módszerek és eredmények pontos leírásához. A karriered egy bizonyos pontján arra is fel kell használnod, hogy bizonyítékot szolgáltass arra, hogy egy ötlet valóban “a tiéd” volt, vagy hogy igényt tarts a szellemi tulajdonodra. Továbbá, tudományos kötelességszegési vádak esetén, laboratóriumi jegyzetfüzete nélkülözhetetlen eleme lesz a vizsgálatnak. Végül a laboratóriumi jegyzetfüzet a karrier főkönyveként fog működni, és tudósként örökségének részévé válik. Ne hanyagolja el!
– Jeremy C. Borniger, a kaliforniai Palo Alto-i Stanford Egyetem idegtudományi posztdoktori munkatársa

hagyományos papírfüzetet, digitális eszközöket vagy kombinációt használ?

szeretek kézzel írott jegyzetfüzetet használni, annak ellenére, hogy az általam készített adatok többsége digitális. Időnként technikai részleteket is rögzítek—például a mikroszkópok konkrét beszerzési beállításait, vagy hogy mely kísérleteket gyűjtöttem össze, hogy ábrát készítsek-szöveges fájlokban, ahol a legkönnyebben megtalálom őket. A hagyományos papír alapú Notebookok egyik kihívása azonban az, hogy nem mindig könnyen kereshetők, ezért az első néhány oldalt a tartalomjegyzék karbantartására használom, és a digitális adatfájljaimat a lehető leggyakrabban kereszthivatkozom.
– Kitaoka

az elektronikus laboratóriumi notebook sokkal jobb, mint a papír. Kereshető, így könnyen lekérhetem az évekkel ezelőtt végzett kísérletek rekordjait, vagy átfésülhetem, hogy megtaláljam a legfontosabb részleteket. Soha nem fogom elpusztítani azzal, hogy véletlenül feltölt egy főzőpoharat etanollal. És amíg ezt alátámasztod, lehetetlen veszíteni. Plusz, kesztyű nélkül kell kitöltenem az asztalomnál, ami arra kényszerít, hogy szánjak rá egy kis időt.
– Bartman

kutatási karrierem kezdete óta használtam egy papírfüzetet, de idővel alkalmazkodnom kellett a stratégiámhoz, mivel eltévedtem az összes oldalon. Ma, csak a laboratóriumi jegyzetfüzetemet használom, hogy menet közben lejegyezzem a gyors jegyzeteket. Minden optimalizált protokollom, nyers adatom és elemzésem a számítógépen tárolódik. Összehasonlítom a jegyzetfüzet bejegyzéseimet és a számítógépes fájlokat a dátum és az egyes kísérletek rövid leírása alapján. Ezenkívül hasznosnak tartom egy külön kutatási jegyzetfüzet vezetését olyan szélesebb kérdésekhez, mint egy kísérlet konceptualizálása, kézirat elkészítése, találkozó szervezése vagy jegyzetek készítése egy konferencián.
– Karine Salin, az IFREMER környezeti fiziológiájának állandó kutatója Plouzanban, Franciaországban

több ötletet kapok papíron, ezért kezdetben minden áron szerettem volna egy hagyományos notebookot. De több projekten dolgoztam, és szükségem volt a jegyzetfüzetemre, hogy kereshető és címkézhető legyen, hogy könnyebben nyomon követhető legyen. Az édes pont számomra egy olyan digitális jegyzetfüzet használata volt, mint az Evernote, azzal a képességgel, hogy pillanatképeket tartalmazzon a hagyományos tollról és papírjegyzetekről, valamint a kódoló szkriptekről és más digitális fájlokról és képekről, amelyeket generáltam. Továbbá, ha az alkalmazás a telefonomon van, azt jelentette, hogy járás közben rögzíthetek hangjegyzeteket, ha van egy ötletem, amelyet később ki akarok próbálni. Azonban egy digitális notebook szinte lehetetlen megtalálni a dolgokat, amit elfelejtett, mint akkor csak pöckölte át az oldalakat a papír notebook. Legyőztem a kérdést azzal, hogy a kísérletek szempontjából valamivel kevésbé releváns dolgokat—például nem kapcsolódó ötleteket és további folytatandó kérdéseket—a “random” címkével címkéztem, hogy hébe-hóba böngészhessem őket inspiráció keresése céljából.
– Ferro

munkám nagy részéhez elegendő egy papírfüzet. Ügyeljen azonban arra, hogy bármilyen jegyzetről digitális biztonsági másolatot készítsen, ha képet készít a Genius Scan alkalmazás segítségével, vagy felírja őket a Microsoft Word-be. Van egy számítógépes mappám is, ahol az összes szokásos protokollomat tárolom, hogy egyszerűen hivatkozhassak rájuk, ahelyett, hogy az egészet a jegyzetfüzetembe írnám minden alkalommal, amikor kísérletet végzek. Ezenkívül minden egyes munkaterülethez külön címkézett kötőanyagok vannak, ahol olyan jegyzeteket és adatokat helyezek el, amelyek nem könnyen illeszkednek a jegyzetfüzetbe, például Microsoft Excel nyomtatványok, grafikus adatok, szerződések és anyagátviteli megállapodások.
– Borniger

írom a digitális notebook Org-mód, a jelölőnyelv kifejezetten könnyen beszúrni kézzel írt képek, mint az eredmények, számítások, egyenletek, táblázatok, bibliográfiák, sőt darab kódot. Maga a notebook több összekapcsolt egyszerű szöveges fájlból áll, így amikor van papírom írni, könnyen felhasználhatom a szöveges fájlokat vázlatként, ha LaTeX fájlba exportálom őket.
—Falessi

elsősorban elektronikus jegyzetfüzetet használok, de gyakran a laborban először papírfüzetbe írom a jegyzeteimet—soha egy darab papírt -, majd beolvasom a papírfüzetemet is, hogy bármikor hozzáférhessek annak tartalmához. A Confluence-t használom az elektronikus rekordhoz, de a Microsoft OneNote egy másik jó lehetőség, mivel offline és online is használhatja, és ingyenes. Kereszthivatkozást használok a papírfüzetem oldalszámai, valamint a kísérletek dátumai és nevei alapján a fájlneveimben. Az összes protokollom a digitális jegyzetfüzetemben van-gyakran képekkel a kísérleti beállításaimról, anyagokról, felszerelésekről, néha pedig egy videofelvétellel, amelyen a protokoll minden lépésén keresztül beszélek. A nyers adataimat a labor szerverén tárolom, és biztonsági másolatot készítek a felhőben és egy merevlemezen. Az adatok feldolgozására és elemzésére szolgáló kódom a Github-on található, amely egy népszerű szoftververziós rendszer. Végül az elektronikus jegyzetfüzetemben egy teendők listáját vezetem, amely nyilvántartásként szolgál arról is, amit minden héten elértem.
– Lina Colucci, a Cambridge-i Massachusetts Institute of Technology Egészségtudományi és technológiai kutatócsoportja és a San Francisco Bay Area data science tanácsadó vállalkozója

milyen stratégiákat használ a notebook szervezéséhez, teljességéhez és a legjobb gyakorlatoknak megfelelően?

számomra az működik, hogy a jegyzetelést létfontosságú kísérleti lépésként kezeljük. Általában leírom a dolgokat, ahogy megyek, időnként leírom a protokollt vagy azt, amit tenni fogok a kísérlet megkezdése előtt, majd szerkesztek bármit, amit a tervezettnél másképp csináltam. Ily módon a laboratóriumi jegyzetfüzet vezetése hasonló a szakácshoz, ahol az egész folyamat során történő takarítás sokkal könnyebbé teszi, mint a végéig várni, amikor az edényeket a mennyezetre rakják. A laboratóriumi jegyzetfüzet mielőbbi kitöltése szintén csökkenti annak esélyét, hogy elfelejtsen egy létfontosságú információt vagy hibát vezessen be.

a papírfüzetem rendezése szempontjából egyszerűen követem az időrendi sorrendet, így minden oldal új nap (kivéve, ha egy nap több oldalt használok). Gondoskodom arról, hogy jelen időben részletes leírást adjak arról, hogy mit tettem, miért és hogyan; a munka elvégzésének dátumát, idejét és helyét; azoknak a személyeknek a nevét, akikkel a munkát végeztem; a munka során bekövetkezett különleges körülmények (például volt-e tűzjelző, amely befolyásolhatta az eredményeket?); és az aláírásomat, és amikor csak lehetséges, egy tanújelet (általában a vezető nyomozómat vagy a labortársamat). Mindezt tollal kell megírni, és ha valami hiba volt, ne húzzuk át teljesen; csak egy sort tegyünk át rajta, hogy még mindig olvasható legyen. Az ötletek (nem pedig a módszertan) leírása szintén elfogadható és ösztönözhető.
– Borniger

a papírfüzetemben minden kísérlet egymást követő oldalak halmaza, mivel túl nehéz lett számomra az egyes kísérletek követése, ha másokkal keveredtek. Ha egyszerre több kísérletet végzek, üres helyet hagyok a feljegyzéseim között, így az egyes kísérletekkel kapcsolatos összes jegyzetem és protokollom folyamatos, még a többnapos kísérleteknél is. A részletek valóban elkészítik vagy megtörik a notebookot, ezért igyekszem tömör lenni, miközben a lehető legtöbb releváns részletet belefoglalom.
– Kitaoka

azt mondom a diákjaimnak, hogy nem kell egy meghatározott formátumot követniük a papírfüzetükben, amíg az összes információ ott van és könnyen megtalálható. Leíratom velük, amit csak tudnak, mielőtt elkezdik a kísérletet. Azt is utasítom őket, hogy rögzítsék az eljárást menet közben, mivel gyakran véletlenül elmulasztják vagy lépéseket tesznek, és ez fontos a felvételhez. Az első kísérleteik valószínűleg sok részletet igényelnek az eljárás beállításáról és végrehajtásáról—míg miután megtapasztalták őket, csak a releváns változókat kell megjegyezniük. Soha ne rögzítsenek külön jegyzeteket a későbbi másoláshoz, mivel ez elkerülhetetlenül Elveszett információhoz vezet.
– Danielle Solano, egyetemi docens és a kémiai és Biokémiai Tanszék elnöke a Kaliforniai Állami Egyetemen Bakersfieldben

az egyik legnehezebb dolog a laboratóriumi jegyzetfüzet fenntartásában annak eldöntése, hogy mikor írjon alapos bejegyzést és mikor írjon felületeset. Mindig azzal kezdem, hogy minden kísérlethez leírok egy minimális mennyiségű információt. Ez általában magában foglalja a dátumot, az időt, a helyet, a protokollparamétereket, az adatok tárolásának helyét, és—ha kódot használok—a szkript nevét és a Github kód verzióját. Aztán, amint rájövök, hogy egy adott kísérlet nem zsákutca, írok egy hosszabb jelentést, amely leírja a kísérlet célját; hipotézis; az adatgyűjtés dátuma(I); linkek az adatokhoz, elemzési szkriptek, az adatgyűjtés napján készített jegyzetek és a teljes protokoll; képek vagy videók a kísérleti beállításról; eredmények; következtetések; és végül a következő lépések.

a papírfüzetem minden oldalát időrendben tartom és dátumozom, és gyakran felteszem azt a helyet is, ahol elvégeztem a kísérletet, vagy megírtam a jegyzeteimet. Ha beragasztok valamit a jegyzetfüzetbe, aláírom és randizom a szalagon. Ha visszamegyek és megváltoztatok valamit egy régi oldalon, aláírom és dátumozom a változást. Az elektronikus notebookomhoz automatizált napi biztonsági mentéseket ütemezek.
– Colucci

a nap első kísérletének megkezdésekor létrehoznék egy jegyzetet az Evernote-on a dátummal, és hozzáadnám hozzá, ahogy megyek, pillanatfelvételeket készítek a tollamról és a papírjegyzetekről a laboratóriumban, majd később további jegyzeteket szervezek az alkalmazásban. Minden nap végén 15 percet szántam arra, hogy elolvassam a bejegyzésemet, és átfogalmazzak mindent, ami nem volt világos, mert túl gyorsan írtam le, feltöltöttem további képeket vagy elemzéseket, és hozzáadtam néhány végső gondolatot. Befejezésül a megfelelő címkézés hozzáadásával zárnám.
—Ferro

a jegyzetfüzetemnek két átfogó szakasza van-az egyik a finomított protokollokhoz, amelyeket néhány alkalommal új kísérlet elvégzése után állítottam össze, a másik pedig a kísérletrekordokhoz. A második szakaszhoz jegyzeteket és megfigyeléseket írok le a hulladékpapírra, miközben kísérleteket végzek, és később szervezettebb módon írom be az információkat az e-notebookomba. Ez lehet szuper bosszantó, hogy töltse ki a laboratóriumi notebook elvégzése után egy fárasztó és összetett kísérlet, de lehet, hogy a legkritikusabb időben! Azokban a napokban, amikor valóban el kell halasztanom, az íróasztalom egy részét kísérleti jegyzeteknek tartom, amelyet másnap fel tudok használni a notebook frissítésére.
– Bartman

további Tanács?

én nagyon ajánlom az elején egy kutatási tapasztalat, mint egy próbaidőszak lab notebook módszerek találni egy megközelítést, hogy működik az Ön számára. A fő kritériumok az, hogy egyszerű és kényelmes a használata és könnyen menthető. Ennek ellenére egyetlen módszer sem tökéletes, ezért korlátozódjon három vagy négy eszköz kipróbálására. Megtanultam a nehéz utat, hogy egy csomó különböző eszközzel való kísérletezés hátránya, hogy az adatok szétszóródnak a Notebookok között, ami nagyon nehéz lehet megtalálni azt, amit keres.
– Colucci

a próbálkozásokon és hibákon kívül megtanultam, hogy mi kerüljön a jegyzeteimbe azáltal, hogy elolvastam a korábbi laboratóriumi tagok jegyzetfüzeteit, és kitaláltam, hogy mi a leírásban könnyebbé vagy nehezebbé tette a kísérlet reprodukálását. Az információ hiánya nagyon frusztráló lehet, és a kísérleteimet a lehető legegyszerűbben szeretném nyomon követni.
– Kitaoka

feltéve, hogy nem szegsz meg semmilyen szabályt, ne félj fejleszteni a saját jegyzetelési módját. Az egyik intézménynek, amelyet meglátogattam, megvannak a saját irányelvei, de mivel az egyéni megközelítésem bevált számomra, úgy döntöttem, hogy folytatom, és hetente egyszer lefordítom a munkámat egy megfelelő jegyzetfüzetbe. Lehet, hogy extra munkának tűnik, de számomra vagy ezt tettem, vagy kockáztattam, hogy abbahagyom a laboratóriumi jegyzetfüzetem következetes használatát, ami nagyobb veszteséget jelentett volna nekem, a laboratóriumomnak, sőt az intézménynek is.

először házimunkának tűnhet, de annak nyomon követése, hogy mit csinálsz, nagyszerű hangulatemelő lehet. Egy kutatási projekt sok kísérleti hullámvölgyből áll, de leginkább a hullámvölgyekből, így egy kicsit kék és haszontalan érzés nagyon gyakori. Visszatekintve a notebookjára, lehetővé teszi, hogy a dolgokat perspektívába helyezze, és rájöjjön, hogy valójában mennyit ér el.
– Ferro